일반적으로 정보시스템의 감사 영역 별 발견사항이 회계감사 계획에 미칠 수 있는 영향은 각 영역 별로 다음과 같다.
입력통제
입력통제상의 약점은 회계자료의 오류로 연결됨으로 기말 감사 시 관련된 회계자료에 대한 입증감사절차를 강화하여야 한다.
자료처리 통제
자료처리에 대한 약점은 회계정보의 오류로 연결됨으로 기말 감사 또는 기중 감사 시 관련된 처리에 대한 재계산등의 절차를 취하여야 한다. 이를 위 하여 CAAT를 활용하거나 전문 정보시스템 감사인에게 의뢰하여 보다 광범위한 재계산을 하는 등 감사범위의 확대를 고려하여야 한다.
출력통제
출력 통제가 적절하게 이루어지지 않는 경우에는 피감사회사가 제시한 자료에 대한 합계검증 등의 절차를 수행하여야 한다.